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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha : |
01/11/2021 |
Actualizado : |
01/11/2021 |
Tipo de producción científica : |
Capítulo en Libro Técnico-Científico |
Autor : |
FERREIRA, V.; GONZÁLEZ-ARCOS, M.; PIANZZOLA, M.J.; COLL, N.S.; SIRI, M.I.; VALLS, M. |
Afiliación : |
VIRGINIA FERREIRA, Área Microbiología, Departamento de Biociencias (DEPBIO), Facultad de Química, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay; MATIAS GONZÁLEZ-ARCOS, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; MARÍA JULIA PIANZZOLA, Área Microbiología, Departamento de Biociencias (DEPBIO), Facultad de Química, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay; NÚRIA S. COLL, Centre for Research in Agricultural Genomics (CSIC-IRTA-UAB-UB), Bellaterra, Catalonia, Spain; MARÍA INÉS SIRI, Área Microbiología, Departamento de Biociencias (DEPBIO), Facultad de Química, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay; MARC VALLS, Centre for Research in Agricultural Genomics (CSIC-IRTA-UAB-UB), Bellaterra, Catalonia, Spain; Department of Genetics, University of Barcelona, Bellaterra, Catalonia, Spain. |
Título : |
Molecular detection of Ralstonia solanacearum to facilitate breeding for resistance to bacterial wilt in potato. |
Fecha de publicación : |
2021 |
Fuente / Imprenta : |
In: Dobnik D., Gruden K., Ram?ak ?., Coll A. (eds). Solanum tuberosum. Methods in Molecular Biology, 2021, vol 2354. Humana, New York, NY. doi: https://doi.org/10.1007/978-1-0716-1609-3_18 |
Serie : |
eBook Packages Springer Protocols, (Methods in Molecular Biology, volume 2354). |
ISBN : |
978-1-0716-1608-6 (print) / 978-1-0716-1609-3 (e-book) |
ISSN : |
1064-3745 (print) / 1940-6029 (electronic) |
DOI : |
10.1007/978-1-0716-1609-3_18 |
Idioma : |
Inglés |
Notas : |
Article history: First Online 27 August 2021. |
Contenido : |
ABSTRACT. - Potato bacterial wilt is caused by the devastating bacterial pathogen Ralstonia solanacearum. Quantitative resistance to this disease has been and is currently introgressed from a number of wild relatives into cultivated varieties through laborious breeding programs. Here, we present two methods that we have developed to facilitate the screening for resistance to bacterial wilt in potato. The first one uses R. solanacearum reporter strains constitutively expressing the luxCDABE operon or the green fluorescent protein (gfp) to follow pathogen colonization in potato germplasm. Luminescent strains are used for nondestructive live imaging, while fluorescent ones enable precise pathogen visualization inside the plant tissues through confocal microscopy. The second method is a BIO-multiplex-PCR assay that is useful for sensitive and specific detection of viable R. solanacearum (IIB-1) cells in latently infected potato plants. This BIO-multiplex-PCR assay can specifically detect IIB-1 sequevar strains as well as strains belonging to all four R. solanacearum phylotypes and is sensitive enough to detect without DNA extraction ten bacterial cells per mL in complex samples. The described methods allow the detection of latent infections in roots and stems of asymptomatic plants and were shown to be efficient tools to assist potato breeding programs. © 2021, Springer Science+Business Media, LLC, part of Springer Nature. |
Palabras claves : |
Bacterial wilt; Disease resistance; Plant breeding; Potato brown rot; Ralstonia solanacearum; Solanum tuberosum. |
Asunto categoría : |
F30 Genética vegetal y fitomejoramiento |
Marc : |
LEADER 02607naa a2200301 a 4500 001 1062509 005 2021-11-01 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a1064-3745 (print) / 1940-6029 (electronic) 024 7 $a10.1007/978-1-0716-1609-3_18$2DOI 100 1 $aFERREIRA, V. 245 $aMolecular detection of Ralstonia solanacearum to facilitate breeding for resistance to bacterial wilt in potato.$h[electronic resource] 260 $c2021 490 $aeBook Packages Springer Protocols, (Methods in Molecular Biology, volume 2354). 500 $aArticle history: First Online 27 August 2021. 520 $aABSTRACT. - Potato bacterial wilt is caused by the devastating bacterial pathogen Ralstonia solanacearum. Quantitative resistance to this disease has been and is currently introgressed from a number of wild relatives into cultivated varieties through laborious breeding programs. Here, we present two methods that we have developed to facilitate the screening for resistance to bacterial wilt in potato. The first one uses R. solanacearum reporter strains constitutively expressing the luxCDABE operon or the green fluorescent protein (gfp) to follow pathogen colonization in potato germplasm. Luminescent strains are used for nondestructive live imaging, while fluorescent ones enable precise pathogen visualization inside the plant tissues through confocal microscopy. The second method is a BIO-multiplex-PCR assay that is useful for sensitive and specific detection of viable R. solanacearum (IIB-1) cells in latently infected potato plants. This BIO-multiplex-PCR assay can specifically detect IIB-1 sequevar strains as well as strains belonging to all four R. solanacearum phylotypes and is sensitive enough to detect without DNA extraction ten bacterial cells per mL in complex samples. The described methods allow the detection of latent infections in roots and stems of asymptomatic plants and were shown to be efficient tools to assist potato breeding programs. © 2021, Springer Science+Business Media, LLC, part of Springer Nature. 653 $aBacterial wilt 653 $aDisease resistance 653 $aPlant breeding 653 $aPotato brown rot 653 $aRalstonia solanacearum 653 $aSolanum tuberosum 700 1 $aGONZÁLEZ-ARCOS, M. 700 1 $aPIANZZOLA, M.J. 700 1 $aCOLL, N.S. 700 1 $aSIRI, M.I. 700 1 $aVALLS, M. 773 $tIn: Dobnik D., Gruden K., Ram?ak ?., Coll A. (eds). Solanum tuberosum. Methods in Molecular Biology, 2021, vol 2354. Humana, New York, NY. doi: https://doi.org/10.1007/978-1-0716-1609-3_18
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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Volumen
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Estado
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Tacuarembó. |
Fecha actual : |
27/03/2018 |
Actualizado : |
02/04/2018 |
Tipo de producción científica : |
Abstracts/Resúmenes |
Autor : |
KUHN, J.; MADEIRA, W.; DIAZ, S.; SOSA, M.; ALBORNOZ, A.; VIANA, A.; ELOY, L.; BREMM, C.; JAURENA, M.; LATTANZI, F. |
Afiliación : |
SAULO SEBASTIAN DIAZ OLIVERA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; MARTIN OSORIO SOSA PINTADO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ALFONSO ALBORNOZ PAZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ANA CAROL VIANA GRASSI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; MARTIN ALEJANDRO JAURENA BARRIOS, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; FERNANDO A. LATTANZI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. |
Título : |
Em diferentes sistemas de manejo podemos identificar a matéria verde de pastagens naturais com base no NDVI? [Resumen]. |
Fecha de publicación : |
2018 |
Fuente / Imprenta : |
In: CONGRESO ASOCIACIÓN URUGUAYA DE PRODUCCIÓN ANIMAL (6º, Marzo, 2018, Tacuarembó, Uruguay). Resúmenes. Tacuarembó: AUPA, 2018. |
Páginas : |
p. 76 |
Idioma : |
Español |
Contenido : |
As pastagens naturais do Bioma Pampa caracterizadas pela diversidade de espécies, principalmente gramíneas e leguminosas, as quais constituem a base da dieta animal. Reconhecer a qualidade dessas forrageiras, por meio da porcentagem de matéria verde produzida nestes campos é uma maneira de maximizar o desempenho animal e otimizar recursos forrageiros. Nesta pesquisa, avaliou-se sistemas de manejo: 4, 8, 12 e 16 kg de matéria seca (MS)/100 kg de peso vivo (PV), pastagem natural fertilizada e pastagem natural fertilizada com introdução de Lotus angustissimus, cujo objetivo foi verificar relação entre porcentagem de matéria verde com dados do Índice de Vegetação Normalizada (NDVI), obtidos com o GreenSeeker®. Ambos sistemas de manejo são manejados pelo método de pastejo com lotação contínua e taxa de lotação variável para ajuste das ofertas de forragem preconizadas. Os dados foram coletados nas Estações Experimentais da UFRGS e Glencoe, pertencente ao INIA Tacuarembó. Realizaram-se cinco cortes (quadro de 0,25m2) em cada bloco, totalizando dez amostras por nível de intensificação. A avaliação da massa de forragem total foi estratificada em massa de forragem verde (MV) e morta (MM), separadas manualmente. Conforme as equações, observa-se que o conteúdo de matéria verde na matéria seca total, em todos os sistemas avaliados na estação primaveril, apresentou comportamento linear crescente em função do NDVI (?=44,50+54,06x; P=0,0033; R2=78,71%); (?=33,83+56,64x; P=0,052; R2=39,38%); (?=-21,34+134,36x; P=0,0967; R2=30,67%); (?=-63,35+195,34x; P=0,0010; R2=76,03%); (?=-2,74+92,67x; P=0,0023; R2=75,54%); (?=-58,82+172,20x; P=0,0028; R2=69,35%) para 4, 8, 12, 16 kg de MS/100 kg PV, fertilizado e fertilizado com introdução de espécie, respectivamente. Para essas equações, foram observadas variações nos intervalos de confiança (IC) de -30,33 até 299,06, sendo o menor IC foi observado para sistema de manejo de 4 kg MS/100 kg PV (25,97 a 82,14), diferindo apenas do sistema de manejo 16 kg MS/100 kg PV, que apresentou um IC de 105,92 a 284,74. MenosAs pastagens naturais do Bioma Pampa caracterizadas pela diversidade de espécies, principalmente gramíneas e leguminosas, as quais constituem a base da dieta animal. Reconhecer a qualidade dessas forrageiras, por meio da porcentagem de matéria verde produzida nestes campos é uma maneira de maximizar o desempenho animal e otimizar recursos forrageiros. Nesta pesquisa, avaliou-se sistemas de manejo: 4, 8, 12 e 16 kg de matéria seca (MS)/100 kg de peso vivo (PV), pastagem natural fertilizada e pastagem natural fertilizada com introdução de Lotus angustissimus, cujo objetivo foi verificar relação entre porcentagem de matéria verde com dados do Índice de Vegetação Normalizada (NDVI), obtidos com o GreenSeeker®. Ambos sistemas de manejo são manejados pelo método de pastejo com lotação contínua e taxa de lotação variável para ajuste das ofertas de forragem preconizadas. Os dados foram coletados nas Estações Experimentais da UFRGS e Glencoe, pertencente ao INIA Tacuarembó. Realizaram-se cinco cortes (quadro de 0,25m2) em cada bloco, totalizando dez amostras por nível de intensificação. A avaliação da massa de forragem total foi estratificada em massa de forragem verde (MV) e morta (MM), separadas manualmente. Conforme as equações, observa-se que o conteúdo de matéria verde na matéria seca total, em todos os sistemas avaliados na estação primaveril, apresentou comportamento linear crescente em função do NDVI (?=44,50+54,06x; P=0,0033; R2=78,71%); (?=33,83+56,64x; P=0,052; R2=39,38%);... Presentar Todo |
Palabras claves : |
BIOMA PAMPA; MATERIA SECA VERDE; NDVI; PASTAGENS NATURAIS. |
Thesagro : |
CAMPO NATURAL. |
Asunto categoría : |
A50 Investigación agraria |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/9029/1/AUPAP76.pdf
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Marc : |
LEADER 02997nam a2200289 a 4500 001 1058354 005 2018-04-02 008 2018 bl uuuu u01u1 u #d 100 1 $aKUHN, J. 245 $aEm diferentes sistemas de manejo podemos identificar a matéria verde de pastagens naturais com base no NDVI? [Resumen].$h[electronic resource] 260 $aIn: CONGRESO ASOCIACIÓN URUGUAYA DE PRODUCCIÓN ANIMAL (6º, Marzo, 2018, Tacuarembó, Uruguay). Resúmenes. Tacuarembó: AUPA$c2018 300 $ap. 76 520 $aAs pastagens naturais do Bioma Pampa caracterizadas pela diversidade de espécies, principalmente gramíneas e leguminosas, as quais constituem a base da dieta animal. Reconhecer a qualidade dessas forrageiras, por meio da porcentagem de matéria verde produzida nestes campos é uma maneira de maximizar o desempenho animal e otimizar recursos forrageiros. Nesta pesquisa, avaliou-se sistemas de manejo: 4, 8, 12 e 16 kg de matéria seca (MS)/100 kg de peso vivo (PV), pastagem natural fertilizada e pastagem natural fertilizada com introdução de Lotus angustissimus, cujo objetivo foi verificar relação entre porcentagem de matéria verde com dados do Índice de Vegetação Normalizada (NDVI), obtidos com o GreenSeeker®. Ambos sistemas de manejo são manejados pelo método de pastejo com lotação contínua e taxa de lotação variável para ajuste das ofertas de forragem preconizadas. Os dados foram coletados nas Estações Experimentais da UFRGS e Glencoe, pertencente ao INIA Tacuarembó. Realizaram-se cinco cortes (quadro de 0,25m2) em cada bloco, totalizando dez amostras por nível de intensificação. A avaliação da massa de forragem total foi estratificada em massa de forragem verde (MV) e morta (MM), separadas manualmente. Conforme as equações, observa-se que o conteúdo de matéria verde na matéria seca total, em todos os sistemas avaliados na estação primaveril, apresentou comportamento linear crescente em função do NDVI (?=44,50+54,06x; P=0,0033; R2=78,71%); (?=33,83+56,64x; P=0,052; R2=39,38%); (?=-21,34+134,36x; P=0,0967; R2=30,67%); (?=-63,35+195,34x; P=0,0010; R2=76,03%); (?=-2,74+92,67x; P=0,0023; R2=75,54%); (?=-58,82+172,20x; P=0,0028; R2=69,35%) para 4, 8, 12, 16 kg de MS/100 kg PV, fertilizado e fertilizado com introdução de espécie, respectivamente. Para essas equações, foram observadas variações nos intervalos de confiança (IC) de -30,33 até 299,06, sendo o menor IC foi observado para sistema de manejo de 4 kg MS/100 kg PV (25,97 a 82,14), diferindo apenas do sistema de manejo 16 kg MS/100 kg PV, que apresentou um IC de 105,92 a 284,74. 650 $aCAMPO NATURAL 653 $aBIOMA PAMPA 653 $aMATERIA SECA VERDE 653 $aNDVI 653 $aPASTAGENS NATURAIS 700 1 $aMADEIRA, W. 700 1 $aDIAZ, S. 700 1 $aSOSA, M. 700 1 $aALBORNOZ, A. 700 1 $aVIANA, A. 700 1 $aELOY, L. 700 1 $aBREMM, C. 700 1 $aJAURENA, M. 700 1 $aLATTANZI, F.
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